眼菌蚊的小龄幼虫在培养料内取食，大龄幼虫则蛀食香菇等菌类的子实体。防治方法包括保持菇房、菇场及周围环境的清洁卫生，栽培前对菇房、菇场进行喷药杀虫，可使用40%的敌敌畏1000—1500倍液喷洒。出菇期间若发生眼菌蚊，同样可用40%的敌敌畏1000—1500倍液或25%的菊乐合酯2000倍液喷杀。此外，香菇还可能受到链孢酶、青霉、黄曲霉、木酶等菌类的感染，以及白蚁、线虫、蛞蝓等害虫的侵害。干菇储藏期还需防范谷蛾、谷盗等害虫。这些虫害对香菇生产构成威胁，因此采取适当的防治措施是确保香菇生产顺利进行的关键。