大蒜在种植中常遇到的病害有根腐病、叶枯病、干腐病、灰霉病、菌核病等,均为土传性真菌病害。大葱常见的土传病害包括根腐病、烂根病、软腐病、猝倒死苗等,这类病害的发生与土壤带菌、肥料带菌、种子未杀毒等原因有关,常导致烂根死苗、茎基部腐烂、烂苗死棵猝倒等现象,严重影响大葱的产量和质量。大蒜冬季常见的病虫害有蚜虫和软腐病,主要病虫包括软腐病、黄叶花病、咖啡豆象等。防治病害可用25%多菌灵500倍液喷施,虫害可用90%晶体敌百虫1500倍液喷施。姜瘟病可通过轮作茬和播种时药剂处理防治,发病初期可用3%生菌素600-800倍液、20%噻森铜300-500倍液、20%叶枯唑400倍液或50%氯溴氰尿酸1000倍液灌墩,发现病株立即用30%王铜悬浮剂800倍液灌根。冬季大蒜土传病害一般较轻,因土传病害多为弱生性真菌引起,低温干燥环境下致病力较弱。