梅雨天气利于发病和蔓延。地势低洼、偏施氮肥、通风透光不良、管理不善的果园以及老弱树发病重。5月上旬至6月上中旬的低温多雨有利于病原的侵染蔓延。
病原菌的侵染程度取决于寄主组织的幼嫩程度和抗病力。若早春花期低温多雨,幼嫩组织(穗轴)持续时间长,木质化缓慢,植株瘦弱,病苗扩展蔓延快,随穗轴老化,病情渐趋稳定。老龄树一般较幼龄树易发病;肥料不足或氮磷配比失调者病情加重;地势低洼、通风透光差、环境郁闭时发病重;品种间抗病性存有差异,高抗品种有龙眼、玫瑰露、康拜尔早、密而紫,玫瑰香则几乎不发病,其次有北醇、白香蕉、黑罕等。
穗轴褐枯病是葡萄的主要病害。中国各地均有发生。