环腐病菌在土壤中存活时间很短，但在土壤中残留的病薯或病残体内可存活很长时间，甚至可以越冬。收获期是此病的重要传播时期，病薯和健薯可以接触传染。在收获、运输和入窖过程中有很多传染机会。防治策略应采取以加强检疫，杜绝菌源为中心的综合防治措施。
(1)建立无病留种田，尽可能采用整薯播种。有条件的最好与选育新品种结合起来，利用杂交实生苗，繁育无病种薯。(2)种植抗病品种经鉴定表现抗病的品系有：东农303、郑薯4号、宁紫7号、庐山白皮、乌盟601、克新1号、丰定22、铁筒1号、阿奎拉、长薯4号、高原3号、同薯8号等。(3)播前汰除病薯。把种薯先放在室内堆放五、六天，进行晾种，不断剔除烂薯，使田间环腐病大为减少。此外用50mg/kg硫酸铜浸泡种薯10分钟有较好效果。(4)结合中耕培土，及时拔除病株，携出田外集中处理。5.栽培管理施用磷酸钙作种肥，在开花后期，加强田间检查，拔除病株及时处理，防治田间地下害虫，减少传染机会。
田间马铃薯发生环腐病主要的原因是种薯带毒。马铃薯在切块种植的过程中，通过切刀的切削传染病菌。马铃薯环腐病防治方法：①严格执行检疫制度。②建立无病留种地。③切刀消毒。④选用抗病马铃薯品种。环腐病菌在种薯中越冬，成为翌年初侵染来源。病菌也可以在盛放种薯的容器上长期成活，成为薯块感染的一个来源。病菌主要靠切刀传播。
