消化道、呼吸道粘膜广泛充血、出血；腺胃粘液增多，可见腺胃出血，腺胃和肌胃之间交界处粘膜可见带状出血。心冠及腹部脂肪出血。输卵管的中部可见乳白色分泌物或凝块；卵泡充血、出血、萎缩、破裂，有的可见“卵黄性腹膜炎”。脑部出现坏死灶、血管周围淋巴细胞管套、神经胶质灶、血管增生等病变；胰腺和心肌组织局灶性坏死。禽流感的病理变化受鸡的品种和感染病毒的毒力影响，流感具有发病率高、病死率低、致病性强的特点，病死鸡的急性死亡率最高，无明显病变。心包积水、心包膜点状或横纹肌坏死。消化道的改变表现为胃黏膜下出血，十二指肠、盲肠、扁桃体环状出血，泄殖腔出血，肝脾肾出血。呼吸道有大量炎性分泌物或黄白色囊肿样物质。胸腺出血、萎缩。母鸡卵泡充血，严重时卵泡破裂，卵黄散在腹腔内，形成卵黄性腹膜炎。腹腔腹膜炎伴浆液性粘液，输卵管水肿及充血。病变为腹部皮下有黄色胶冻样浸润。全身浆膜、肌肉出血；心包液增多，呈黄色，心冠脂肪及腹壁脂肪出血；肝脏肿胀，肝小叶之间出血；气囊炎；口腔黏膜、腺胃、肌胃角质层及十二指肠出血；盲肠扁桃体出血、肿胀、突出表面；腺胃糜烂、出血，肌胃溃疡、出血。头骨、枕骨、软骨出血、脑膜充血；卵泡变性、输卵管退化、卵黄性腹膜炎、输卵管内有蛋清样分泌物；胰腺有点状白色坏死灶；个别鸡肌胃皮下出血。病变：颈和胸部皮下有黄色胶冻样液体和充血；腺胃轻度出血、腺胃和肌胃的交界处黏膜轻度出血；胰腺出血，胰腺表面有量的白色或淡黄色坏死点；口腔、肌胃角质膜下、十二指肠出血；胸部肌肉、脂肪、胸骨内面小点出血；心脏也有散在出血点；肝、脾、胃、肺常见有灰黄色坏死灶；心包有充血或积液，有些病例有纤维素样渗出物；蛋鸡或种鸡，卵泡充血、出血、萎缩，输卵管内可见乳白色分泌物或凝块，有的见卵泡破裂。头部眼周围、耳和肉髯水肿。