大葱软腐病由细菌引起，高温高湿、机械伤、虫口伤容易引起病害流行。病害症状为大葱地上部分倒伏，容易拔起，茎下部腐烂，并有恶臭。植株外部的1～2张叶片基部产生半透明灰白色斑，叶鞘基部软化腐烂，致使外叶折倒，并继续向内扩展，致使整株呈水浸状软腐，并伴有恶臭。
该病危害鳞茎，田间鳞茎膨大期，在1～2片外叶的下部，一般在假茎抽长期开始发病，先从脚叶的叶缘或中脉发病。初期在基部近地面处出现水渍状病斑，形成黄白色条斑，可贯穿整个叶片，温度高时，病部呈黄褐色软腐状，后逐渐向上部叶片扩展，进而外叶折披、软化腐烂，致全株枯黄。病害症状为大葱地上部分倒伏，容易拔起，茎下部腐烂，引起全株倒伏，并有恶臭。
大葱软腐病一般先从茎基由下向上扩展，初侵染呈水渍状长形斑点，后产生半透明状灰白色病斑，接着叶鞘基部软化腐烂，致叶片折倒，病斑向下扩展，假茎部染病初呈水浸状。最后内部开始腐烂，散发出细菌病害所特有的恶臭味。葱长在外部的叶子下放会产生灰白色或者半透明的病斑，叶鞘基部会软化最终往往呈现倒伏。葱头颈部（书面语常说鳞茎颈部）会出现被水淹过一样的软状凹陷，要不了多久里面就会腐烂恶臭。
在大葱生长后期，植株外部的1～2张叶片基部产生半透明灰白色斑，叶鞘基部软化腐烂，致使外叶折倒，并继续向内扩展，致使整株呈水浸状软腐，并伴有恶臭。在大葱或洋葱生长后期，植株外部的1~2张叶片基部产生半透明灰白色斑，叶鞘基部软化腐烂，致使外叶折倒，并继续向内扩展，致使整株呈水浸状软腐，并伴有恶臭。
