柑橘花芽分化通常在秋稍老熟后进入冬季气温下降而停止营养生长时开始，具体时间与品种有关，至初春气温回升时止。柑橘的花芽分化分为生理分化和形态分化两个阶段。
1、柑橘花芽的生理分化：生理分化决定花芽的数量，一般发生在9-11月，是积累形成花芽的营养物质、激素调节物质、遗传物质等的过程。这一过程为形态分化做准备。
2、柑橘花芽的形态分化：生理分化完成后进入形态分化期，叶芽生长点组织逐渐可区分出花芽和叶芽，各种花器官逐渐形成，包括花瓣、雌蕊、雄蕊等。形态分化一般从11月下旬开始，历时120多天，到第二年3月中下旬结束，决定开花的质量。
根据经验，秋梢期管理正常的情况下，甜橙类在9月下旬开始转入花芽分化，结束基本在12月；橘类稍迟，约在10月转入化分，结束至迟为次年1月。花芽分化的早迟在同一品种也会因秋梢早或迟抽出相关。秋梢在“立秋”时节抽出（常称“正造秋梢”）时，花芽分化会相应早进入；9月上旬抽的秋梢，其花芽分化会迟一些。
