防治方法包括合理轮作、药剂拌种和种植抗病品种等综合措施。种植抗病品种时需注意谷子白发病菌的不同生理小种。农业防治方面,轻病田块实行2年轮作,重病田块实行3年以上轮作,轮作作物可选大豆、高粱、玉米、小麦和薯类等。施用净肥,避免使用病株残体沤肥、带病谷草做饲料及谷子脱粒后场院残余物制作堆肥。在“白尖”出现但尚未变褐破裂前拔除病株,并带到地外深埋或烧毁,需大面积连续拔除并坚持数年。药剂防治可用25%甲霜灵可湿性粉剂或35%甲霜灵拌种剂,以种子重量0.2%~0.3%的药量拌种,或甲霜灵与50%克菌丹按1:1配比混用,以种子重量0.5%的药量拌种,可兼治黑穗病。拌种方法可采用干拌、湿拌或药泥拌种,湿拌和药泥拌种效果更佳。土壤带菌量大时,可沟施药土,每公顷用40%敌克松3.75千克,掺细土15~20千克,撒种后沟施盖种。