鸭疫里默氏杆菌病潜伏期一般1～3天，有时可长达7天。最急性病例常无明显症状而突然死亡。急性病例的主要临床症状包括嗜睡、缩颈、喙抵地面、两肢软弱、不愿走动、行动迟缓、共济失调、食欲减退甚至废绝。眼有浆液性或黏液性分泌物，粪便稀薄，呈绿色或黄绿色，部分雏鸭腹部膨胀。濒死期出现神经失调的症状，如摇头、点头或背脖，两肢伸直呈角弓反张状态，进而出现全身痉挛性抽搐，很快死亡。少数病例出现阵发性痉挛，在短时间内发作2～3次后死亡，病程一般为1～3天。4～7周龄的雏鸭，病程可达7天以上，呈亚急性或慢性经过。慢性病例常能存活，但发育不良，体态消瘦，失去经济价值。少数病例出现头颈歪斜，不断鸣叫，时而转圈，时而后退。安静时，症状稍有缓解，也可采食、饮水，无明显病症。还有少数病例出现张口呼吸等呼吸困难的症状，常因发育不良，体态消瘦，衰竭而死亡。也有的病例出现跗关节肿胀，跛行，伏卧不起。多见于1-8周龄的小鸭，呈急性或慢性败血症，临诊上主要表现为眼和鼻分泌物增多、喘气、咳嗽、下痢、共济失调和头颈震颤。