防治方法：加强饲养管理，农区和牧区春夏多发病期间少抢青、抢茬，实行牧草场轮换放牧，经常给羊饮用0.1%高锰酸钾溶液，秋季避免吃过量结籽饲草。常发病期定期注射羊厌氧菌病三联苗（羊快疫、羊猝殂、羊肠毒血症）或五联苗或近年试验成功的六联苗（羊快疫、羊肠毒血症、丰猝殂、羊传染坏死性肝炎、羔羊痢疾和大肠杆菌病）。皮下或肌肉注射5毫升。在疫区每年应在发病季节前，注射羊肠毒血症菌苗或羊肠毒血症、快疫、猝疽三联菌苗。
及时清扫羊舍内外的环境卫生，认真执行消毒制度，及时将运动场的积水滩填平，避免羊饮用受病原菌芽胞污染的积水。控制好饲养密度，保持栏舍通风，给羊群提供优质的饲草，放牧尽量选在高燥地区，春季和夏季避免过量食用青绿多汁、富含高蛋白的饲草，秋冬季节注意不宜食用过量的结籽饲草。
由于羊肠毒血症病程短，发病突然，因此，每年春季3—4月和秋季9—10月注射三联苗或五联苗。
