油菜种子为球形或近球形,大小因类型、品种和环境条件不同而异,一般千粒重3-4g。色泽有黄、红褐、褐、黑和杂色等多种,其色泽深浅与品种和成熟度有关。一个角果最终发育形成10-30粒左右的种子。种子由胚珠受精后发育而成,由种皮、胚和胚乳组成。种皮较坚硬,包裹在种子外表,起保护种子的作用,约占种子重量的12%-20%。种皮里面是黄色的胚,通称种仁。胚由胚根、胚轴、胚芽和两片肥大卷曲的子叶组成,子叶主要由薄壁细胞组成,含有丰富的颗粒状的油滴和糊粉粒,是油菜重要的贮藏器官。油脂主要是以油体的形式分布在细胞中。一般甘蓝型油菜品种含油量35%-45%左右,蛋白质25%左右。白菜型、芥菜型油菜含油量相对较低。胚乳是包围在胚外面的一层薄膜,细胞较大。