系统性侵染病害,抽穗后出现典型症状。病果穗短小,不吐花丝,除苞叶外整个果穗都变成一包黑粉,为病菌的冬孢子。黑粉飞散后露出丝状寄主维管束组织。雄穗有时也形成黑粉包,但常常仅个别小穗受害,有时还发现花器变形呈叶片状。病株大多矮小,只有健株的1/3-2/5,偶尔也在剑叶中脉发生条状黑粉堆。玉米丝黑穗病主要侵害果穗和雄穗,雄穗发病,部分或整个花器变形,基部膨大,内包黑粉。雌穗发病,果穗短粗,除苞叶外,其余全部被病菌所破坏,外观像健穗,但内部全都是黑粉或很多散乱的黑色丝状物,病株大多矮化。丝黑穗病在苗期感染,而在后期表现症状。雄穗受害,部分或全部花器变形,颖片增多,不能形成雄蕊,雄花基部膨大,其内充满黑粉。果穗受害,除苞叶外,全部被病菌破坏,变成一大团黑色干粉。黑粉病是局部浸染性病害。被害部分因病菌的刺激而肿大成瘤状。病瘤表面包有白色或淡红色的薄膜,后期薄膜破裂,散出黑褐色粉末。通常叶片和叶鞘上的病瘤较少,产生的黑粉也很小,而茎节和穗上的病瘤较大,产生的黑粉也较多。