处理玉米秸秆及根茬是消灭玉米螟的基础措施。玉米收获后至春季4月底以前，应将玉米地里的根茬及玉米秸秆、穗轴等通过烧掉、沤肥、用作饲料加工粉碎或封垛等方式处理完毕，以消灭越冬虫源，减轻第一代幼虫为害。同时，玉米收获时尽量齐地面收割，以减少根茬中的越冬虫量。
在药剂防治方面，春玉米和夏玉米均以心叶末期在玉米大喇叭口内施用颗粒剂效果最佳。可使用1.5％辛硫磷颗粒剂以1：15的比例与细煤渣拌匀后撒入喇叭口内，或每亩用1%辛硫磷颗粒剂1～2公斤，与5倍细沙土混匀后撒入喇叭口内，或用0.3%辛硫磷颗粒剂，每株2克，撒入喇叭口内。此外，在玉米雌穗吐丝达60％时，将上述药剂撒在雌穗穗节上面两片叶的叶腋及穗顶的花丝上。对低龄幼虫，每亩可用5.7％氟氯氰菊酯乳油30毫升，或10％高效氯氰菊酯乳油20毫升，兑水50千克对喇叭口、叶腋和叶背面喷雾。
玉米螟的天敌种类繁多，主要包括寄生卵赤眼蜂、黑卵蜂，寄生幼虫的寄生蝇、白僵菌、细菌、病毒等。捕食性天敌有瓢虫、步行虫、草蜻蛉等，这些天敌对虫口有一定的抑制作用。
