根腐病是辣椒常见病害之一，严重时会导致绝产，需注意防治。在种植时，应自育无病幼苗进行移植，并做好田间管理。
选择合适的地块，整理好后作为育苗地，选择优质辣椒品种，对种子进行浸种处理，在适宜时期播种，与豆科、禾本科作物进行3-5年轮作。精耕细作，培育壮苗，移植时尽量不伤根，移植后精心整理，保证土壤不积水沤根，并施足基肥。适时浇水，防止地上和植株内水分蒸发。
定植后根据气温变化，适时适量浇水，防止地上水分蒸发、苗体水分蒸腾，隔绝病毒感染。喷施促花王3号，促花芽分化，多开花，多坐果。分别在花蕾期、幼果期、果实膨大期喷施辣椒壮蒂灵，增强植株营养匹配功能，使果蒂增粗，促椒体健康生长，增强抗病能力。定植后温度控制在20～30℃、地温25℃、湿度不高于90%，使幼苗茁壮成长。
若发病，及时拔除病株，并喷施恶霉甲霜水剂或咯曲腈悬浮剂等药剂。
