青枯病菌在土壤中并非以休眠状态生存,而是在发病植株或某些杂草的根际繁殖。主要通过作业过程中的伤口或根瘤线虫、蓝光丽金龟幼虫等根部害虫造成的伤口侵染植株,在茎的导管部位和根部发病,有时也会通过无伤口细根侵入。青枯病菌在10—41℃下生存,最适温度为35—37℃。在中国上海及长江中下游地区,辣椒青枯病的主要发病期为5-10月。夏季高温、闷热、高湿有利于发病;大雨或连阴雨后骤然放晴,气温迅速升高,田间湿度大,易导致病害流行;连作田、低洼田、雨后积水、偏酸土壤的田块发病较重;种植密度过高、偏施氮肥也易引发病害。