杂菌防治：①培养料先经堆制发酵，利用多种高温型微生物所产生的生物热杀死害虫和中低温菌类，减少污染源。②快速装袋灭菌。配制后的培养偏酸性，适于各种微生物生长与繁殖，所以应尽量在5小时内装完毕，灭菌时要求在4—6小时使温度上升到100℃。③培养室降温、通风，可以减少杂菌污染，提高接种成品率。如要防止木霉的污染，可把接种后的菌袋先在16℃下培养，这时香菇菌丝可以生长，而木霉的孢子难以萌发，菌丝生长缓慢。待香菇菌丝体在培养料表面生长到一定程度后，再逐步提高温度，最后在25℃下培养到菌丝体长满全袋。④局部污染的菌袋，可注射20%甲醛溶液或5%石碳酸，以控制污染点的扩散。对蛞蝓、白蚁的防治，可参照段木栽培的防治方法进行。对跳虫的防治，在出菇期可用0.1敌敌畏拌少量蜂蜜诱杀，或用0.1%鱼藤精或150—200倍除虫菊液喷洒。香菇生产防治杂菌感染的工作在栽培香菇的全过程中，都是十分重要的，稍有不慎，就会前功尽弃，带来不应有的损失。所以，在每个环节，都要按操作规程工作，把感染率减少到最低点。