条斑病主要侵染水稻叶片，有时也侵染叶鞘。病斑发生与扩展限制在叶脉间，初为暗绿色水渍状小斑，后扩展成为黄褐色略带湿润状的条斑，长可达1cm以上。病斑上常溢出大量串珠状黄色菌脓，干后呈小胶粒状。病斑边界清楚，对光观察呈半透明条斑。发病严重时条形病斑融合成不规则黄褐至枯白色大斑，严重感病稻田远望一片橘红色，似火烧状。
在水稻幼苗期发病就可看到症状，叶片上初为暗褐色水渍状透明的小斑点，后沿叶脉扩展形成暗绿色至黄褐色细条斑，其上生有许多露珠状蜜黄色菌脓。病斑可以在叶片的任何部位发生，严重时，许多条斑还可以连接或合并起来，成为大块枯死斑块，外形与水稻白叶枯病有些相似，但仔细观察时，仍可看到典型的条斑症状。即使在干燥的情况下，病斑上也可以看到较多蜜黄色菌脓。菌脓色深量多，不易脱落。病斑边缘不呈波纹状弯曲，对光检视，仍有许多透明的小条斑，病斑可在全生育期任何部位发生。
细菌性病斑初为暗绿色水浸状小斑，很快在叶脉间扩展为暗绿至黄褐色的细条斑，病斑两端呈浸润型绿色。白叶枯病斑上菌溢不多不常见到，而细菌性条斑上则常布满小珠状细菌液。叶片卷曲，田间呈现一片红黄色。同时能引起稻株早期干枯或者病株不能抽穗；即使抽穗结实，但秕谷增多，千粒重降低。
