芹菜晚疫病主要危害叶片，其次危害叶柄、茎、种子。有大斑和小斑之分。大斑由芹菜小壳针孢菌侵染引起，一般先发生在老叶上，逐渐向新叶上扩展。发病初期为淡黄色水浸状斑，后变为淡褐色或褐色园斑，边缘明显，病斑上散生少数小黑点，即分生孢子器，危害严重时，全株叶片变为褐色干枯状。茎及叶柄受害，病斑均呈长圆形，稍凹陷，中央密生黑色小粒点。小斑由芹菜大壳针孢菌侵染引起，后期病斑中央黄白色或灰白色，边缘聚生有很多黑色小粒点，病斑边缘黄色，大小不等。叶柄或茎部上的病斑为褐色，长圆形稍凹陷，中部散生黑色小点。
首先应施足基肥，一般应施用优质腐熟鸡粪1500千克/亩，同时在生长期中适当追肥，这是芹菜高产优质的保证条件。追肥种类应以速效性氮肥为主，并注意磷、钾肥和生物有机肥的配合应用，做到轻肥勤施，小水常浇。苗期：播种前将育苗床表土与肥料充分拌匀、耙细、整平。出苗后10天左右追施一次速效性稀薄氮肥，当长出3～4片真叶时可追施一次磷钙肥。大田：基肥在定植前7～10天深翻混入土中，晒白后耙平畦面，开定植沟。追肥应勤施薄施，由稀薄逐渐加浓，宜用尿素和生物有机叶面肥，不用硝态、铵态氮肥以免伤根，降低产量和品质。
