多年连作导致土壤营养和水分大量消耗，土壤中存在大量病残体和病原菌，常引发花生根腐病的流行，并传染给次年的同种作物。病菌主要随病残体在土壤中越冬，成为病害的主要初侵染源，带菌的种仁、荚果及混有病残体的土杂肥也可成为初侵染源。病菌主要借流水、施肥或农事操作传播，从作物伤口或表皮直接侵入，病株产生分生孢子进行再侵染。
花生根腐病的传播途径主要有三种：
1.土壤：土壤中含有病菌是发病的主要条件，尤其是多年重茬种植花生的地块，病菌数量多，发病重，难防治。病菌在土壤缝隙中越冬，待第二年温度适宜后开始传播危害。
2.病残体：田间残留的花生叶片或植株是病菌的栖息地，病菌在病残体中越冬，下一年继续危害。若上茬花生根腐病严重，收获时田间病残体较多且未及时清理，下一年种植时根腐病会加重。
3.种子：花生播种时，自身携带的病菌是重要来源，尤其是自留种。若地块已发生根腐病，使用该地块的花生作为自留种，种子携带的病菌会在播种后危害。此外，小厂家生产花生种时未详细除杂，也可能携带病菌。
除以上三种途径外，病菌还可通过雨水传播，如下雨时随雨水流动传播。农户在田间进行农事操作时，也会导致病菌传播。苗期多阴雨、湿度大时发病重，连作田、土层浅、沙质地易发病。
