深耕可打破犁底层，扩大了根系吸收养分的范围，提高土壤保水保肥能力，扩大小麦抗旱防涝能力，掩埋有机肥料、粉碎的作物秸秆、杂草和病虫害。然而，深耕也存在不利于小麦当年增产或可能造成减产的问题，并且每年深耕耗费能量较大，在干旱年份还会严重损害土壤墒情。