稻曲病除选择抗性品种，加强水肥管理、增施磷钾肥，防止迟施偏施氮肥外，适期喷药预防是关键措施。建议在水稻破口前10天左右(孕穗大肚明显时)及时选用戊唑醇、肟菌戊唑醇(拿敌稳)、烯唑醇、氟环唑、烯肟菌胺.戊唑醇、井.烯.环唑、井冈腊芽菌、蜡质芽孢杆菌、咪鲜胺、苯甲嘧菌酯等药剂喷施预防，若阴雨或湿度较大天气日数多，破口期再防治一次，效果较好。若稻曲病已发生时，因防治效果较差，从成本及防效等角度不建议再选用药剂防治。病菌以分生孢子器在病叶中越冬。次年花期条件适宜时产生分生孢子，随风雨传播进行初侵染和再侵染。一般于6月上旬开始发病，8月中下旬为发病盛期。老弱树发病较重，降雨早、雨量大、次数多的年份发病较重，特别是7～8月的降雨对病害影响较大。地势低洼、土质黏重，排水不良等有利于病害发生。