生物防治。保护利用天敌，注意检查天敌发生数量，当卵寄生率达60％以上时，尽量避免施用化学杀虫剂，防止杀伤天敌。瓜绢螟的天敌已知有4种卵期的拟澳洲赤眼蜂、幼虫期的菲岛扁股小蜂和瓜绢螟绒茧蜂、幼虫至蛹期的小室姬蜂。其中拟澳洲赤眼蜂大量寄生瓜螟卵，每年8—10月，日均温在17—28℃时，瓜螟卵寄生率在60％以上，高时可持续10天以上接近100%，可明显地抑制瓜螟的发生和为害。
农业防治。结合防治白粉病、霜霉病,及时去除下部老叶、病叶,可以增加防效和杀死老叶内的虫蛹;加强田园的清洁工作,铲除棚室周围的杂草,瓜果采收完毕以后,瓜蔓及时清理出棚深埋,降低蛹量和蛹的成活率。
化学防治。在幼虫一至三龄时,喷药防治,使用一些生物农药防治效果较好,可选用丁纳,40毫升一桶水,喷雾防治。或选用下列药剂进行防治：35%氯虫苯甲酰胺水分散粒剂4~6克/亩；或10%甲维盐茚虫威悬浮剂20~25毫升/亩；或5%阿维菌素乳油1000~2000倍液。
