土壤湿度大是发病的主要因素。高温高湿,土壤湿度大,根系发育不良。该菌生育适温22~24℃,生产上遇有低温不利于根系生长发育,当土温低于20℃,且持续时间较长时,易诱发此病,土壤粘重的重茬地及地下害虫严重的地块发病重。每年11月至翌年4月是日光温室西葫芦根腐病多发的季节。病菌以卵孢子或菌丝体在土壤中存活,田间持水量在75%以上,地温15~18℃,最易发病。土壤中病菌从根部伤口侵入,借灌溉水传播蔓延,进行再浸染。高温、高湿利于发病,连作地、低洼地发病重。西红柿根腐病病原属半知菌亚门真菌,病菌以菌丝体和卵孢子随病残体在土壤中越冬。在苗床内传播主要是带菌的土壤、肥料、农具和浇水等。病菌从幼苗伤口侵入,再借雨水、灌溉水传播。