在银杏树生长期间，可以选择施加发酵后的农家肥，再配合少量以磷肥为主的复合肥。施肥应在春季银杏树发芽前进行，此时多使用农家肥，再施一次化肥，夏季和入秋后也要各施肥一次。施肥时，可以在下雨前进行，将肥料施在根系旁，降雨后肥料会随雨水渗入土壤中。基肥主要用有机肥，有机肥料养分全，且可以改良土壤结构。科学地确定施肥量需考虑树势、产量、树龄、品种、土壤、气候及管理水平等因素。根外追肥的最佳时间在傍晚，此时根系吸收和利用率高，最好选择在下雨后进行。秋季可穴施有机肥和复合肥，即在树冠周围或树盘内挖深40-60厘米、直径50厘米的穴。银杏对营养元素的吸收从发芽前开始，氮的吸收高峰在6～8月，主要与新梢旺盛生长及种子的迅速发育密切相关；钾的吸收高峰为7～8月，主要与种子的迅速膨大有关；磷的吸收量较氮、钾均少，且各生长期比较均匀。