早稻纹枯病要求防治两次，第一次在6月15日前后，隔10天左右进行第二次防治。防治药剂可使用5%井冈霉素200毫升/亩或12%纹曲清水剂150毫升/亩。适时早防是防治本病成功的关键，分蘖末期至孕穗期是防治的关键时期，其中分蘖末期是重点有效防治期，孕穗至始穗期也是防治此病的关键期。常用的防治纹枯病的杀菌农药有春雷霉素、多抗霉素、己唑醇、戊唑醇、吡唑醚菌酯等，这些药剂对水稻纹枯病的防治效果突出。在水稻破口前期，可选用用量低、杀菌谱广且有促增产作用的防治药剂组合。加强田间管理，控制分蘖末期速效性肥料的使用，以水控病，防治关键时期降低水层结合晒田方式可有效控制病情；同时抓好水平横向感染期和垂直感染期的药剂防治。
