药剂防治是柑橘砂皮病防治的重要措施。第一施药在柑橘幼果期进行,大约在花谢2/3的时候,尤其是在冻害严重的区域,此时选择的药剂多以治疗性药剂和保护性药剂相结合,比如治疗性药剂中的戊唑醇、苯醚甲环唑等,保护性药剂中的代锌锰锌、皮唑嘧菌酯等。第二次施药大约在幼果期15天进行,根据天气状况以及第一次施药的情况决定,喷施的药剂与第一次类似。在幼果期到壮果期以及夏稍期可结合柑橘溃疡病的防治进行。果实膨大期根据当地雨水情况和秋稍生长情况间隔15-20天施药一次,此次施药同样采用保护性药剂和治疗性药剂相结合的方式。