油菜的主要虫害包括蚜虫和潜叶蝇。防治方法包括使用40%乐果乳油或40%氧化乐果1000～2000倍液，20%灭蚜松1000～1400倍液，50%辟蚜雾可湿粉3000倍液，40%水胺硫磷乳剂1500倍液，2.5%敌杀死乳剂3000倍液等药剂。此外，可在油菜田设置黄板诱杀蚜虫，或利用蚜茧蜂、草蛉、瓢虫、食蚜蝇等进行生物防治。
花期缺硼会导致主花序和分枝花序明显矮化，顶端萎缩；不断抽发次生分枝继续开花，延迟花期，花蕾、幼荚大量脱落，荚果萎缩细小、畸形，如胖壮、扭曲等，结实率很低，有的甚至绝荚。油菜缺硼时，其根、茎、叶、花、蕾、果都不能正常生长发育，特别是角果会因花器退化而出现“阴角”，形成花而不实，导致菜籽产量明显降低。
