高粱黑穗病在苗期症状不明显，但植株会稍微微化，颜色略深。抽穗后，被害植株抽穗较早、较矮，节数减少，最终影响产量。穗期显症时，病株不矮化，通常全穗子粒都变成卵形的灰包，外膜坚硬，不破裂或仅顶端稍裂开，内部充满黑粉。病粒受压后散出黑粉，中间留下一短而直的中轴。
高粱黑穗病有散黑穗病、坚黑穗病和丝黑穗病三种。散黑穗病的病穗及其籽粒和内外颖都变为黑粉，外面包一层暗灰色的薄膜，后期薄膜易破，破后散出黑粉，剩下长形的中轴。病株比健株稍矮，抽穗早于健株。坚黑穗病的病穗及其籽粒呈灰色，长圆形，内充满黑粉，外有坚硬薄膜，不易破裂。丝黑穗病整个病穗变成一个灰包，外面包有白色薄膜，病菌成熟时灰包容易破裂，散出大量黑粉，留下像头发一样的黑色乱丝。
防治方法包括：
1.轮作和选用抗病品种：实行3年以上轮作，选用抗病品种，适时栽培，拔除田间病株并深埋烧毁。
2.拌种：每100千克种子可选用25%粉锈宁右湿性粉剂0.4千克、35%菲醌粉剂0.2-0.3千克、20%萎锈灵乳油1.25升、50%多菌灵可湿性粉剂0.7千克、40%五氯基苯粉剂0.5-0.7千克、25%百坦拌种剂0.042-0.075千克或40%拌种双可湿性粉剂0.2千克，加适量水拌种，拌后堆闷4小时，阴干后播种。
3.药剂处理种子：2%立克秀按种子重量的0.1—0.2%拌种或50%禾穗胺按种子重量的0.5%拌种；20%粉锈宁乳油100毫升加少量水拌种100公斤，摊开晾干后播种；20%萎锈灵乳油0.5公斤加水3公斤拌种40公斤，闷种4小时后晾干播种。
4.实行3年以上轮作，减少土中菌量。
5.适期晚播，争取早出苗、出全苗，及时砍倒病株并在灰包破裂之前集中销毁。
