锈病应采取以抗病品种为主的综合措施。加强栽培管理，适期播种，合理密植，控制氮肥用量，防止植株贪青晚熟；合理排灌，低洼地雨后及时排水，降低田间湿度。感病品种在气候适宜谷子锈病流行的年份应行药剂防治。
谷子锈病防治方法：(1)选用抗锈品种。如朝425、豫谷11、复1等能有效提高产量和品质。(2)种子处理。播种前对种子进行包衣剂包衣，或用15%粉锈宁可湿性粉剂按种子重量的2%拌种，能有效降低发病率，提高植株抗锈病能力。(3)药剂防治。发病初期，喷洒40%氟硅唑乳油9000倍液。当病叶率达1%~5%时，可用15%粉锈宁可湿性粉剂800倍液进行喷药，隔7~10天后酌情进行第二次喷药，也可用50%萎锈灵可湿性粉剂1000倍液喷雾防治。
