病菌以菌核在土壤、病残体及种子中越冬。翌年气温回升至5℃以上，土壤潮湿时，菌核萌发产生子囊盘，子囊孢子成熟后由子囊内弹射出去，借气流传播，遇向日葵萌发侵入寄主。种子上的越冬病菌可直接为害幼苗，菌核上长出的菌丝也可侵染茎基部引起腐烂。病菌生长温度范围为0~37℃，最适温度为25℃。菌核形成温度范围为5~30℃，最适温度为15℃，菌核经3~4月休眼期后产生子囊盘。形成子囊盘的温度范围为5~20℃，最适温度为10℃。菌核埋入土中7cm以上时很难萌发。子囊孢子萌发温度范围为0~35℃，5~10℃萌发最快，该菌能侵染41科200余种植物。春季低温、多雨时茎腐严重，花期多雨时盘腐严重。适当晚播以错开雨季，发病较轻。连作田土壤中菌核量大，病害重。