马铃薯黑痣病的发生与气候条件、种薯质量和耕作栽培措施密切相关，其中气候条件是主导因素。较低的土壤温度和较高的土壤湿度有利于丝核菌的侵染，结薯期土壤湿度过大、排水不良会加重薯块上菌核的形成。多年连作的地块发病较重，管理粗放、土壤板结、透气性不良、排水性差的地块，种薯出苗时间长、长势弱，发病较重。
随着马铃薯产业的发展壮大，种植面积不断扩大，重茬情况普遍，加之马铃薯频繁调种引种，马铃薯黑痣病的发生呈逐年加重趋势，一般可造成马铃薯减产15%左右，严重影响马铃薯的产量和品质。病原菌以菌核和菌丝体在土壤、病株病残体及感病植物体内越冬，带病种薯是翌年的初侵染源，也是远距离传播的主要载体。马铃薯生长期间病菌从土壤中根系或茎基部伤口侵入后发病。
