紫薯幼苗感染黑斑病后，茎基部会产生梭形褐色斑点，逐渐发展成为椭圆形黑斑并凹陷，后期幼苗全部变黑，难以成活。块根发生黑斑病，会出现圆形下凹黑斑，逐步扩大发展，最后失去可食性。防治方法包括实行轮作，选择抗病品种，种植的秧苗用50%托布津可湿性粉剂兑水500倍液浸泡，以提高抗病能力。
根腐病主要表现为叶浅黄、生长慢、须根尖端和中部有黑褐色病斑，出苗晚，出苗率低。严重时，紫薯的根部全部腐烂，感病株结薯多畸形，后期龟裂，皮下组织变黑，茎叶生长缓慢多分枝，后期整株枯死。防治方法包括选用抗病品种，培育壮苗，加强田间管理，深翻、轮作、清洁田园、早栽插，发生病害后使用专业药剂喷洒防治。
软腐病表现为紫薯薯块出现水侵状斑点，后期组织变褐，整个薯块腐烂。
