叶片发病后出现淡黄色不明显病斑纹，后变为深淡不均的花叶病斑。有的新生叶沿叶脉出现浓绿色隆起皱纹，或出现叶片变小、裂片、黄化等症状，严重时植株死亡。瓜受病毒危害后，瓜面出现花斑或凹凸不平的瘤状物，瓜畸形。病毒病号称“植物癌症”，造成危害很大。西葫芦患病可导致叶片尤其是嫩叶皱缩、黄化、小叶等，果实畸形，茎秆产生褐色条斑，植株长势受抑，产量减少。果实受病毒危害后，果实表面出现花斑或凹凸不平的瘤状物，呈畸形。西葫芦受害，呈现系统性斑驳、花叶，叶上有深绿色疱斑，新叶先受害且严重。重病株上，上部叶片畸形呈鸡爪状，植株矮化，叶月变小，不能展开，后期叶片枯黄、死亡，病株不结瓜或结瓜少，瓜面上有瘤状突起、环形斑，小而畸形。
西葫芦病毒病的危害时间较长，幼苗期到成株期均可染病。幼苗期感病，叶片出现绿色斑点，有明脉现象，植株矮化，较为严重时叶片变形呈鸡爪状，叶片失绿起皱并出现蕨叶。成株期感病，植株容易落花导致结实率降低，有的植株会结实，但所结瓜体表面出现肿瘤或黑色斑点，严重影响其外观和口感，还会危害人体健康。此外，感病后，果实在未成熟时比较容易掉落。花叶型表现叶片呈现黄、绿相间花斑，叶面凹凸不平，新叶畸形，节间缩短；严重时植株枯死。蕨叶形表现出矮化症状，叶片皱缩、扭曲，新叶狭长，成鸡爪状或线状。混合型即两种症状皆有。发病植株发育不良，难以坐瓜，或坐瓜小，瓜面有瘤状凸起，凹凸不平。
高温、干旱是发病的主要条件。前茬为黄瓜、甜瓜等作物，或与瓜类作物邻作、间套作也易感病，西葫芦缺肥，管理粗放，生长势弱的植株往往发病较重。棚室西葫芦病毒病全年都可发生，冬春季节发病较轻，夏秋季发病较重，病毒病多在植株进入开花结果期表现症状，此时发病往往造成难以弥补的损失。
