一、严格鸡场消毒。孵化厂要严格执行消毒制度，尤其是种蛋入孵前必须进行严格消毒。同时，养鸡场也应加强管理，搞好卫生消毒工作，防止把病带入鸡场，一旦发生本病，及时处理病鸡，并进行彻底消毒。尽量减少人员、车辆出入，以防引起疾病传播。
二、改进免疫程序。鸡法氏囊病的免疫程序改为：6日龄，鸡法氏囊病中等毒力疫苗每只鸡1羽份饮水；14日龄，鸡法氏囊病中等毒力疫苗每只鸡2羽份饮水；24日龄，鸡法氏囊病中等毒力疫苗每只鸡2羽份饮水；25～26日龄，鸡群全部肌肉注射高免蛋黄每只鸡1毫升；40日龄，鸡法氏囊病中等毒力疫苗每只鸡2羽份饮水，可以有效防止鸡法氏囊病的发生。
三、处理发病鸡群。鸡群发病时，应首先将病鸡隔离，对发病的鸡舍、鸡群、场地、用具等用0.3%过氧乙酸或者2%烧碱喷洒一遍。在育雏阶段如发生本病，应注意提高育雏舍的温度，以尽可能地减少雏鸡死亡率。