在花芽分化和发育期,若连续5到6天遇到低夜温,极易产生畸形果。若低温或干旱持续时间长,幼苗处在抑制生长条件下,花器官发育期拉长、易木/prematurely硬化,转入适宜条件后,硬化组织不能适应迅速生长,易形成裂果、疤果。氮肥过多会使花芽过度分化,心室数目增多,形成多心室畸形果。激素浓度过高、重复蘸花,或蘸花时温度过高、土壤干旱等情况,容易产生畸形果。对未开放的花进行药剂蘸花,易产生空洞果。秧苗徒长时,使用植物生长调节剂浓度大或次数多,使秧苗受控,再蘸花时也易产生畸形果。低温、光照不足、肥水管理不善、植物生长刺激素使用不当,致根冠比失调,花器和果实不能充分发育,出现尖顶、畸形;或养分过多集中输送到正在分化的花芽中,致花芽细胞分裂过旺,心皮数增多,形成多心室畸形果。番茄在持续低温、氮肥、水分及光照充足的条件下,养分过分集中运送到正在分化的花芽中,花芽细胞分裂过旺,心皮数增多,开花后心皮发育不平衡形成多心室畸形果。花期使用生长素浓度过高,果实发育养分供应不足;或点花后花朵尖端残留多余激素水滴,使果实不同部位发育不匀,引起子房畸形发育。水肥管理跟不上,缺硼、钙元素会加剧果实畸形病的发生。引起番茄畸形果的因素主要有:花芽分化时温度偏低;光照不足;肥水管理不当;植物生长调节剂使用不当;苗龄过长;应用了畸形果发生率高的品种。