病原细菌在种子和土壤表面的病残体上越冬，成为翌年的初侵染源。田间的自生瓜苗、野生南瓜等也是该病的初侵染源和宿主。病菌主要从伤口和气孔侵染。该病的远距离传播主要靠带菌种子，种子表面和种胚均可带菌。带菌种子萌发后，病菌就从子叶侵入，引起幼苗发病。病斑上溢出的菌脓借风雨、昆虫及农事操作等途径传播，形成多次再侵染。内蒙古西部5月上旬播种甜瓜和哈密瓜，6月上旬发病，7月份进入发病盛期，病原细菌在瓜上分解糖份以后进入瓜体内部，侵染瓜肉，成熟时腐烂。干旱年份发病轻，高温多雨年份和平作地块发病重。品种间抗病性有差异：哈密瓜皇后系列、86系列发病重。