大豆菌核病是大豆在种植到七月下旬之后易发作的真菌病害。危害的真菌核盘菌，属于子囊菌亚门。最初茎秆上生有褐色病斑，以后病斑上长有白色棉絮状菌丝体及白色颗粒，后变黑色颗粒（菌核）。纵剖病株茎秆，可见黑色圆柱形老鼠屎一样的菌核，病株常枯死呈白色。该种病害可以通过轮作或喷洒农药等方式防治。
大豆菌核病在整个生育期均可发病，造成苗枯、叶腐、荚腐等症状，花期以后发病较重，主要为害茎杆。田间多见植株上部叶片萎蔫变褐枯死，系由茎部受害引起。病株茎部断续发生褐色病斑，上生白色棉絮状菌丝体和白色颗粒状物，后变黑色成为菌核。剖开病株茎部可见有黑色鼠粪状或圆柱状的菌核。病株枯死后呈灰白色，茎中空，皮层腐烂呈麻丝关，病株外部的菌核易脱落。荚上病斑褐色，迅速枯死不能结粒，最后全荚呈苍白色。轻病荚虽可结粒，但豆粒易腐烂或干缩皱瘪。
七月下旬开始发病，主要为害地上部，苗期、成株均可发病，花期受害重，产生苗枯、叶腐、茎腐、荚腐等症。苗期染病茎基部褐变，呈水渍状，湿度大时长出棉絮状白色菌丝，后病部干缩呈黄褐色枯死，表皮撕裂状。叶片染病始于植株下部，初叶面生暗绿色水浸状斑，后扩展为圆形至不规则形，病斑中心灰褐色，四周暗褐色，外有黄色晕圈；湿度大时亦生白色菌丝，叶片腐烂脱落。茎秆染病多从主茎中下部分权处开始，病部水浸状，后褪为浅褐色至近白色，病斑形状不规则，常环绕茎部向上、下扩展，致病部以上枯死或倒折。湿度大时在菌丝处形成黑色菌核。病茎髓部变空，菌核充塞其中。干燥条件下茎皮纵向撕裂，维管束外露似乱麻，严重的全株枯死，颗粒不收。豆荚染病现水浸状不规则病斑，荚内、外均可形成较茎内菌核稍小的菌核，多不能结实。
