病菌以菌丝体和卵孢子随病残体组织遗留在土中越冬,翌年菌丝或卵孢子遇水产生孢子囊和游动孢子,通过灌溉水和雨水传播到甜瓜上萌发芽管,产生附着器和侵入丝穿透表皮进入寄主体内,遇高温高湿条件2~3天出现病斑,其上产生大量孢子囊,借风雨或灌溉水传播蔓延,进行多次重复侵染。该菌腐生性强,在土壤中长期存活,病菌以卵孢子在土壤中越冬或渡过不利环境条件,条件适宜时萌发产生游动孢子或直接长出芽管侵入寄主;在土中营腐生生活的菌丝也可产生孢子囊,释放出游动孢子侵染瓜苗,引起猝倒病;在病残体上又产生孢子囊和游动孢子借雨水溅射到近地面的果实上,侵入后形成绵腐,在田间不断地进行重复侵染。传播主要靠风雨或流水及带菌有机肥,秋后病菌又在病部组织里形成卵孢子越冬。结瓜期阴雨连绵、湿气滞留易发病。