马铃薯退化的原因有内因和外因两个方面。其内因主要是品种生理特性决定的,因为任何品种在遗传过程中,都会发生不同程度的变异。外因方面包括气候条件不良、栽培技术不当以及病虫危害。内因和外因综合作用,导致马铃薯发生退化。马铃薯的退化是由于种薯受病毒侵染引起的。凡以营养器官繁殖的无性繁殖作物,如马铃薯以块茎进行无性繁殖,一旦感染了病毒,就会在植株体内增殖,并通过输导组织运转,积累到新生营养器官中。凡用感染病毒的营养器官作种,就会一代代传播下去,并逐年加重扩大危害。而块茎又不能从自身中排除病毒,因而导致种薯退化,大幅度减产,使品种失去原有的生产潜力。