辣椒疫病对产量、品质影响极大,严重时减产50%以上。该病会危害根、茎叶和果实,常常造成大面积的死株现象,症状主要表现为幼苗立枯、软腐倒折、茎枯萎死亡。成株期染病时,叶片病斑呈圆形或椭圆形,中间呈暗褐色,边缘呈黄色,病斑大小为2~3cm,并伴生白色霉层,同时叶片会逐渐软腐、脱落。茎部受害时,常常会从茎的受害部位倒折,病部以上的叶片会从上至下枯萎死亡。根部染病,主根染病初呈淡褐色湿腐状斑块,后逐渐变为黑褐色,导致根及跟颈部韧皮部腐烂,木质部变淡褐色,引起整株萎焉死亡,可称为“根腐型”。花蕾被害迅速变褐脱落;果实发病,多从蒂部或果缝处开始,初为暗绿色水渍状不规则形病斑,很快扩展至整个果实,呈灰绿色,果肉软腐,病果失水干缩挂在枝上呈暗褐色僵果。