大葱的虫害主要是蓟马和斑潜蝇。蓟马危害时，其成、若虫均以刺吸式口器吸食大葱的嫩尖和心叶汁液，被害葱叶形成许多细密而长形的灰白色斑，叶尖枯黄，严重时叶片扭曲枯萎。斑潜蝇危害时，斑潜蝇的幼虫终生在大葱叶内曲折穿行，取食叶肉，叶片上出现如同蛇形的白色虫道，叶肉被食，只留下两层白色透明表皮，严重时直接影响产量和商品质量。
防治方法：可用50%啶虫脒4000倍液+2%阿维菌素1500倍液或10%吡虫啉750倍液+30%灭蝇胺1000倍液，5～7天喷施一次；严重时可3～5天喷施一次，可有效防治发生。同时，及时清除田间杂草及枯枝落叶有助于减少虫源，遇旱浇水，防止土壤干旱，减轻蓟马危害。因大葱叶片比较光滑，离水性强，在喷洒时可加入0.1%的中性洗衣粉，以增加附着力，提高喷施效果。采收前7天停止用药。
大葱的病害主要是灰霉病，主要危害是叶片，出现圆形或椭圆形白色斑点，由叶尖向下发展，随病情发展病斑连接成片，使葱叶卷曲枯死。高温高湿利于大葱灰霉病发生。防治方法：由于夏季是雨水高发时期，雨后常出现高温高湿，高温高湿易发灰霉病，在防治时尽量同时防治，可用10%吡虫啉750倍液+2%阿维菌素1500倍液+50%腐霉利800倍液或50%啶虫脒4000倍液+80%灭蝇胺2000倍液+45%异菌脲1500倍液，5～7天喷施一次，可有效防治。
