迄今为止，还没有理想的治疗木霉的药物，通用杀菌剂仅能抑制而不能杀死，增加剂量会同时杀死木霉和香菇菌丝。因此，创造适合香菇菌丝体生长且不利于木霉繁殖的生态环境是控制这种危害的基本措施。在种植过程中，要注意净化环境，消除污染源；接种过程中要进行彻底、严格的无菌操作；堆放菌袋以防高温，定期检查；采摘期间避免喷水过多，注意菇房通风。一旦发生木霉为害，要立即通风降湿以抑制其扩展。发菌阶段的培养料感病后，可采用注射药液的方法抑制木霉扩张，常用药液包括5%的石碳酸、2%的甲醛、1：200倍的50%多菌灵、75%甲基托布津、pH值为10的石灰水。此外，往污染处撒白灰面也有良好的防治效果。
