萝卜田如大量施用未腐熟或腐熟不好的有机肥，尤其是圈粪，使土壤中微生物活动旺盛，消耗氧气过多，易造成根部窒息，部分组织会因缺氧而发生黑皮或黑心。萝卜地长期湿度过大，或雨后一定时间地面积水，也易造成根部窒息导致缺氧而发生黑皮或黑心。缺硼容易导致萝卜糠心，严重的可能也会出现黑心。
无病株留种或种子处理：尽量做到在无病田块、无病种株上采种。种子播种前可用温汤浸种，在50℃温水浸种30分钟，立即在冷水中冷却，捞出晒干后播种。或者50%代森铵水剂200倍液浸种15分钟，洗净晒干后播种。与非十字花科蔬菜轮作，采用抗病品种；深翻地，保证肥料不带病原菌；发现病株及时拔除。
