引起仔猪腹泻的原因主要有以下几点：①母猪的乳汁质量不好，过浓或过稀或受感染后乳中带菌。②大肠杆菌、沙门氏菌等都可引起仔猪腹泻，可用抗生素治疗。③轮状病毒和冠状病毒可导致腹泻，但无有效药物治疗，抗生素只能防止继发感染。④植物性饲料，如其中含有豆粕，可使仔猪肠道致敏，所以乳猪料中应含有除豆粕外的优质蛋白质原料。另外，应早日进行仔猪补料，让其消化道适应植物性饲料的变化。⑤产仔舍内卫生条件差，潮湿、温度变化大，小环境条件恶劣等也可引起仔猪腹泻。
仔猪腹泻是一种症状，引起该病的原因很多，有饲养管理方面引起的消化不良类腹泻，也有因为各种传染病引起传染性腹泻，还有中毒性腹泻、寄生虫性腹泻等。第一种，营养和饲养管理引起的腹泻。这种腹泻常见的原因有10多种，如：母猪的乳量不足，代乳料消化不良，维生素、矿物质缺乏，仔猪日粮中过量添加铜，饮水中金属离子超标，仔猪断奶、分群、转舍等应激性因素都能导致腹泻。第二种是细菌性腹泻。常见有黄痢、红痢、白痢、副伤寒和痢疾等。黄痢主要在生后数小时至5日龄以内仔猪发病，以1～3日龄最为多见。红痢主要发生于1～3日龄，一般病程较短，死亡率极高。白痢10～30日龄最为多发，死亡率低，但影响生长发育。仔猪副伤寒多发生在2～4月龄。痢疾主要症状为粘性出血性腹泻。第三种就是病毒性腹泻。常见有传染性胃肠炎、流行性腹泻、轮状病毒感染等。猪传染性腹泻是由传染性胃肠炎病毒引起的一种急性传染病，以呕吐、严重腹泻、脱水和10日龄内仔猪死亡率高为特征，5周龄以上的病猪很少死亡。仔猪流行性腹泻是由冠状病毒引起的高度接触性传染病，多发生于冬春季节。轮状病毒病是由轮状病毒引起的仔猪、犊牛、羔羊、驹、幼免等的急性胃肠炎，仔猪较易患病，10～28日龄猪最易感染，并有明显的腹泻，死亡率较低。
