严重干旱缺水或水分过多长期闷根都会导致小苗发黄，因此播种深度不宜超过5厘米。种植过密、养分分配不均也会引起幼苗发黄。缺锌是玉米生长发育必需的微量元素，尽管需求较少，但作用非常重要。除草剂药害也是常见原因，某些除草剂对玉米敏感，使用不当易引发药害。播种过深会导致幼芽在土壤中消耗过多营养，出现苗弱、苗黄现象。玉米苗期病害，如玉米茎基腐病，严重时会导致幼苗枯死。养分不足，尤其是夏玉米抢时播种未施底肥，播种过密会导致幼苗争夺养分和水分，造成叶片发黄、生长缓慢甚至死亡。
播种深度应控制在3-5厘米，过深易出现苗弱、苗黄，过浅不易出苗。播种时可施入适量种肥，如每亩施入3千克磷酸二铵，促进苗期生长。间苗、定苗应及时，玉米3-4片叶时间苗，6-7片叶时定苗，避免幼苗拥挤争肥、争水、争光，形成弱苗、病苗、黄苗。亩留苗数应根据品种要求灵活掌握。
浇水不足会影响种子正常发芽出苗，导致弱苗、苗期发黄。水渍苗多发生在雨季，低洼地块排水不良或小麦收割时辗压处积水，造成苗黄。苗期长期低温阴雨天气易引发玉米苗枯病，病苗叶片发黄干枯，根系发育不良，形成黄苗弱苗。发病初期可用恶霉灵+叶面肥喷施玉米基部进行防治。
