大豆荚枯病的发生与流行与结荚期降雨量有关,连阴雨天气多的年份发病重。南方多在8~10月,北方8~9月易发病。该病在高温高湿条件下发生,病菌以分生孢子器在病残体上或以菌丝在病种子上越冬,成为翌年初侵染源。