病害的发生与降雨和温度密切相关。分生孢子的传播和侵入需要水滴，而冬季温暖潮湿是病落叶上子囊盘形成的必要条件。冬季温暖潮湿，春雨早、雨量大，夏季阴雨连绵以及秋雨较多的年份，发病早且重；反之病害发生晚而轻。温度主要影响病害的潜育期，在较高温度下，潜育期短，病害扩展迅速。病菌发育适温20～25℃，分生孢子发芽适温20～25℃。分生孢子的传播和侵入需有水，冬季温暖潮湿是病叶与落叶上子囊盘形成的必要条件，冬季不干、春雨早且多的年份有利病害发生流行，特别是春秋雨季提前且降雨量大的年份，病害大流行。从树势、树龄来看，同一品种的幼树较老树抗病；同一株树的当年结果枝发病率较歇果枝高，树冠内膛下部比外部、上部发病早且多，这可能与树冠内部、下部荫蔽、通风透光差、湿度大有关。
栽培条件对病害影响显著。管理不善，地势低洼，排水不良，造成树势衰弱，发病重。
发病与叶龄有一定关系。叶龄35天以内的叶片容易感染发病，11-25天叶龄的叶片最易染病，36天以上的叶片基本不再被侵染。同一株树上当年结果枝上的叶片发病率较歇果枝上的高，树冠内膛下部叶片比外围上不叶片发病早而且多。
品种抗性差异明显。红玉、金冠、富士、北斗、元帅等品种易感病；祝光、国光、鸡冠、倭锦、青香蕉等发病较轻；小国光则表现抗病。
苹果褐斑病病原菌分生孢子的侵染温度为5-30℃，最适温度为20-25℃。苹果生长期内，温度不是病菌侵染的限制因子，温度主要影响病害的潜育期的长短，在较高的温度下，潜育期短，病害扩展迅速。雨水来得早晚和降雨次数多少、降雨量大小而定，降雨早、次数多、雨量大，褐斑病发生早且严重，降雨次数少且雨量小，褐斑病发生晚且轻。
