井岗霉素作用广泛，可用于多种作物病害的防治。
1.水稻病害：
纹枯病：在水稻封行后至抽穗前期或盛发初期，每亩用5%可溶性粉剂100-150克，兑水75-100公斤，针兑水稻中下部喷雾或泼浇，间隔期7-15天，施药1-3次。
稻曲病：在水稻孕穗期，每亩用5%水剂100-150毫升，兑水50-75公斤喷雾。
其他水稻病害包括穗颈瘟、叶瘟病、叶黑粉病、叶尖枯病、云形病和紫秆病等。
2.棉花立枯病：用5%水剂500-1000倍液，按3毫升/平方米药溶液量灌苗床。
3.麦类纹枯病：100公斤种子用5%水剂600-800毫升，对少量水均匀喷在麦种上，搅拌均匀，堆闷几小时后播种。也可在田间病株率达到30%左右时，每亩用5%井冈霉素水剂100-150毫升，兑水60-75公斤喷雾。
其他小麦病害包括白粉病、白秆病、全蚀病、黑粉病、叶枯病、颖枯病、云纹病、叶锈病、秆锈病等。
4.玉米病害：包括轮纹斑病、褐斑病、茎腐病和秆腐病等。
5.蔬菜病害：如番茄、茄子、甜(辣)椒等的立枯病，以及黄瓜的立枯病、白绢病、根腐病等。
6.豆类病害：包括立枯病和白绢病等。