苗期容易得病有猝倒病、立枯病、枯萎、炭疽病等。幼苗团棵到伸蔓时期易得虫蚜、蓟马、蝼蛄等虫害,以及霜霉病、蔓枯病等病害。西瓜叶枯病是西瓜比较常见的病,在春季与秋季发病率较高,主要是由于阴雨天气较多。叶枯病主要危害叶片,其次是藤蔓与果实。多半在幼叶上发病,幼叶上产生不规则褐色斑块,持续生长导致叶片枯萎,在果实与藤蔓上发病时,果实与藤蔓会腐烂。市场上有专门抗叶枯病的抗病品种,例如郑杂7号等。在收获完后要注意清理病瓜,集中烧毁。建立好西瓜地的排水系统,阴雨天气时注意防雨。在未产生病斑前可使用速克灵可湿性粉剂进行喷洒防治,一周一次,持续一个月左右。