玉米丝黑穗病的典型病症是雄性花器变形,雄花基部膨大,内为一包黑粉,不能形成雄穗。雌穗受害果穗变短,基部粗大,除苞叶外,整个果穗为一包黑粉和散乱的丝状物,严重影响玉米产量。病果穗短小,不吐花丝,除苞叶外整个果穗都变成一包黑粉,为病菌的冬孢子。黑粉飞散后露出丝状寄主维管束组织。玉米丝黑穗病是幼苗期侵入的系统侵染性病害,主要危害雌穗和雄穗。多数品种到抽穗期才表现症状。雄穗的小花全部或部分受害,花器变形、颖片变长呈叶片状,不能形成雄蕊。小花基部膨大形成菌瘿,呈灰褐色,易破裂并散出黑粉。雌穗受害时,外观短粗无花丝,除苞叶外,雌穗内部充满黑粉,成熟时苞叶破裂散出大量黑粉,残留丝状的维管束组织,故得名丝黑穗病。受害严重的植株,在苗期可表现各种症状。幼苗分蘖增多呈丛生形,植株明显矮化,节间缩短,叶片颜色暗绿挺直,农民称此病状是“个头矮、叶子密、下边粗、上边细、叶子暗、颜色绿、身子还是带弯的”。